Comme les plus grandes villes du Brésil, Florianópolis a également un taux d’alphabétisation élevé, puisque 93 % de sa population est considérée comme alphabétisée. Ce chiffre impressionnant peut être attribué aux établissements d’enseignement de la ville qui dispensent une éducation de haut niveau.

Parmi ces établissements figurent l’Universidade Federal de Santa Catarina, l’Universidade do Estado de Santa Catarina, le Complexo de Ensino Superior de Santa Catarina, l’Universidade do Sul de Santa Catarina, l’Universidade do Vale do Itajaí, la Faculdade Estácio de Sá et le Centro Federal de Educação Tecnológica de Santa Catarina, entre autres. Parmi ces universités, c’est l’Universidade Federal de Santa Catarina, abrégée en UFSC, qui est considérée comme l’une des meilleures du pays.

Cette université publique, traduite en français par « Université fédérale de Santa Catarina », est classée au quatrième rang des meilleures universités d’Amérique latine par le Webometrics Ranking of World Universities. Elle est également l’une des meilleures universités de recherche de la région, en plus d’être la troisième plus grande institution éducative du Brésil.

Seule université fédérale de Santa Catarina, l’UFSC fait la fierté de la ville et de l’État pour la qualité de ses programmes d’ingénierie tels que l’ingénierie électrique, l’ingénierie mécanique et l’ingénierie de contrôle.

Fondée en 1962, l’université accueille en moyenne 25 000 étudiants de premier cycle et 8 000 étudiants de troisième cycle chaque année.