En Belo Horizonte hay dos universidades: la Universidad Federal de Minas Gerais (UFMG), una universidad pública; y, la Pontífica Universidade Católica (PUC-MG), una universidad privada.

La UFMG, o, Universidad Federal de Minas Gerais, se encuentra en el Barrio de Pampulha, y, en el campus de este lugar, uno de los principales de la universidad, hay centros que se dedican a un ámbito específico. Estos son el Instituto Federal de Investigación en Ciencias Nucleares y, la Estación Ecológica, en donde zoólogos y botánicos llevan a cabo sus investigaciones. La UFMG es una de las cinco instituciones educativas más grandes de Brail y, entre los grados que ofertan se encuentran Medicina, Derecho, Economía, Ingeniería e Informática, considerada como el mejor grado de Brasil.

Por otro lado, la Pontífica Universidade Católica de Minas Gerais, o, PUC-MG, es una universidad católica y una de las más grandes y más destacadas de Brasil, que o solo tiene un campus en Belo Horizonte, sino también en otras localidades de Minas Gerais. La PUC-MG se considera como la mejor universidad para estudiar Ciencias Ambientales, por lo que ha recibido el nombre de Centro de Excelencia en Climatología. Además, ha recibido el premio a la mejor universidad en cuanto a la formación de sus estudiantes y a su inserción en el mundo laboral.